Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms