Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RUNX1T1Q06455 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX1T1Q06455 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms