Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARID5AQ03989 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms