Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GCNT1Q02742 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms