Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSC2Q02487 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSC2Q02487 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms