Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP27A1Q02318 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms