Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU5F1Q01860 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms