Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDM2Q00987 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDM2Q00987 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms