Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms