Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC5Q00444 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC5Q00444 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms