Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H3F3AP84243 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3AP84243 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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