Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMF1P82094 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMF1P82094 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMF1P82094 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMF1P82094 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms