Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSX2P58304 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSX2P58304 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms