Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN5P54829 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN5P54829 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms