Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA2P51531 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms