Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms