Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRIM2P49643 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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