Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RANGAP1P46060 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms