Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3CBP42338 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms