Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms