Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms