Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPB2P35606 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPB2P35606 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPB2P35606 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPB2P35606 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPB2P35606 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPB2P35606 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms