Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXD13P35453 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms