Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms