Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP1P30622 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms