Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms