Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms