Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD247P20963 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD247P20963 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms