Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LIAS-204ENST00000424936 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms