Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GP1BBP13224 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms