Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms