Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF888P0CJ79 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms