Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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