Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms