Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX1O43812 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX1O43812 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms