Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX49Q9Y6V7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
DDX49Q9Y6V7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX49Q9Y6V7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms