Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPO11Q9Y5K1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPO11Q9Y5K1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPO11Q9Y5K1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 512.2 ms