Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB5Q9Y5E4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB5Q9Y5E4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB5Q9Y5E4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB5Q9Y5E4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB5Q9Y5E4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms