Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP3Q9Y446 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP3Q9Y446 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms