Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM2AQ9Y2K7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM2AQ9Y2K7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM2AQ9Y2K7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms