Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DENND2AQ9ULE3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND2AQ9ULE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms