Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCN11AQ9UI33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCN11AQ9UI33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN11AQ9UI33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN11AQ9UI33 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms