Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRP2BPQ9P2M1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRP2BPQ9P2M1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRP2BPQ9P2M1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms