Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP36Q9P275 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms