Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCMF1Q9P0J7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCMF1Q9P0J7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCMF1Q9P0J7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms