Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH4Q9P003 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNIH4Q9P003 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH4Q9P003 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms