Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RRN3Q9NYV6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRN3Q9NYV6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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