Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CWC25Q9NXE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CWC25Q9NXE8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CWC25Q9NXE8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms