Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC39A9Q9NUM3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC39A9Q9NUM3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms