Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD3Q9NPG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FZD3Q9NPG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FZD3Q9NPG1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms